El microsocpio de onda evanescente utiliza el principio de reflexión total para excitar moléculas individuales en una pequeña sección de la muestra, alrededor de 100 micrones. Esta sección, próxima a la superficie de separación muestra/cubreobjeto, entrega una imagen nítida sin contribución de fluorescencia procedente del resto del volumen de la muestra. De esta manera, se pueden observar fenómenos que no se verían por fluorescencia convencional.
El equipo permite operar independientemente, sin modificación alguna, en modo fluorescencia, TIRF o confocal.
Empleando iluminación láser o alternativamente luz blanca (lámpara halógena de 100W), se pueden registrar procesos dinámicos en membranas celulares con alta relación señal/ruido.
Los objetivos Nikon, de alta apertura numérica (especialmente diseñados para TIRF), incluyen un anillo de corrección para compensar efectos de variación de temperatura, entregando imágenes nítidas y de alta resolución.